Nikolaj Thomassen, f. 1973, journalist og forfatter.
Nikolaj Thomassen er uddannet fra Danmarks Journalisthøjskole og har arbejdet med undersøgende journalistik på Politiken, WeekendNu og Dagen. I 2000 modtog han Hørupprisen for sin afdækning af den såkaldte Ligkistesag, ligesom han i 2004 modtog anerkendelse i form af Berlingske Tidendes Journalistpris for bogen Ingen kender Dagen, som blev skrevet sammen med kollegaen Mads Brügger, ligesom bogen Abemanden. De to er i øjeblikket ved at skrive en bog om Tønder-sagen.
Nikolaj Thomassen er desuden medejer af produktionsselskabet Kontrabande.